以危害新疆各族人民健康的民族高发性疾病(高发性肿瘤、代谢综合征等)、感染性疾病(包虫病、结核病等)和人畜共患病等为主要研究对象,以应用基础研究为实验室定位,并适当由基础研究向应用研究延伸;通过对新疆民族高发性疾病、感染性疾病和人畜共患病的流行病学、分子遗传学和分子生物学研究,在分子水平认识这些疾病的发病相关因素、分子发生机制,探讨其早期诊治适宜技术与有效的防治对策, 为新疆民族高发病、感染性疾病和人畜共患病的预防、诊断和治疗提供坚实的基础与防治策略。