石河子大学医学院预防医学系始建于1958年石河子医学院公共卫生教研组，2000更名为石河子大学医学院预防医学系，2003年获批流行病与卫生统计学硕士点；2005年获批社会医学与卫生事业管理硕士点；2013年流行病与卫生统计学获批石子大学校级重点学科。2014年获批石河子大学预防医学重点实验室。2018年获批公共卫生与预防医学一级学科硕士点(科学学位)和公共卫生硕士一级学科硕士点（专业学位)。预防医学专业于2019年获批兵团重点专业。2022年获批“重要新发传染病防控与公共卫生安全”兵团重点实验室。2022年7月，石河子大学成为浙江大学“一拖一”合作共建的高水平公共卫生学院建设高校。

经过67年的发展，石河子大学医学院预防医学系在人才培养、学科建设和专业建设取得了长足进步。近5年培养本科生580人、培养研究生277人；学院培养出的本科生、研究生遍布新疆内外，大多数成为预防医学、公共卫生、卫生事业管理及医学教育等领域的骨干。

预防医学系现有流行病学教研室、卫生统计学教研室、职业卫生与环境卫生学教研室、营养与食品卫生学教研室、社会医学教研室、卫生事业管理教研室、妇幼与儿少教研室和预防医学实验中心8个基层教学组织；目前五家本科专业实习基地以及六家专业硕士研究生产学研基地，为预防医学专业技能培养提供条件。

目前预防医学系现有专任教师37人，其中，教授2人，副教授19人，讲师13人，助教3人，其中博士15人，硕士23人（其中攻读博士7人）。引进华中科技大学公共卫生学院姚平为“绿洲学者”，北京大学郭岩教授和马军教授为“银龄教授”。

预防医学系科学研究紧密围绕国家特别是新疆和兵团的重大公共卫生问题，依据新疆地域、环境特征，形成了特色明显的研究方向和团队：

方向一：新疆高发性代谢性疾病及心血管疾病的病因与发病机制研究：围绕民族高发性疾病（代谢综合征、高血压等）开展致病病因及机制研究

方向二：公共卫生安全风险评估及卫生政策：基于风险识别、风险处理和风险管理，开展新疆公共卫生安全的风险因素评估和卫生政策分析。

方向三：环境安全与人群健康：针对新疆特殊的人居环境，开展危害健康不利环境因素的剖析和机体互作机理研究，分析职业危害因素，探究新疆特殊人居环境污染物病因学机制。

本学科近5年主持国家科技支撑计划、国家自然基金、兵团科技攻关计划、省级横向课题等项目共56项，总经费1588.58万元。发表文章144篇，其中高水平文章88篇；撰写专著6部，10部研究报告被兵团卫健委和自治区卫健委采纳应用，为新疆和兵团公共卫生人才培养和科研事业发展做出了卓越贡献。